近年来的研究证明，乙肝病毒属于泛嗜性病毒，电镜下可见到乙肝病毒在胰腺、肾基底部、胆管上皮及血细胞中的存在。
在乙肝病毒感染者的胆汁标本中检测到HbsAg。
用原位杂交法在乙肝患者的胆道上皮细胞中检出乙肝病毒基因组，说明HBV病毒可以在胆管上皮细胞中复制。以单克隆抗体和ABC法在乙肝患者的胆囊组织检出HbsAg和HBcAg。用PCR 技术在乙肝患者的胆囊中检出HBV-DNA。而且HBV标志物阳性的胆石症患者囊组织中HBV—DNA阳性检出率，明显高于血清HBV标志物阳性的非胆石症患者组织的HBV—DNA阳性检出率。说明肝外组织中有HBV的存在和复制。
目前有学者认为，乙肝病毒在肝外组织存在，进行复制或免疫复合物在肝外组织沉积抗体主要是IgG和IgM,在激活补体清除免疫复合物的同时胆系黏膜上皮也受到破坏，引起免疫损伤,导致病毒性胆管炎、胆囊炎。胆囊炎症状态下胆囊粘膜分泌粘液，糖蛋白明显增加，使胆汁滞留、加速晶体析出形成为胆泥形成提供了条件，尽管并不是所有的胆泥将导致胆石症，但大量实验证明：胆泥形成是胆石形成的必经阶段。以偏振光显微镜证实了所有胆石症患者均见胆泥形成。统计约12.5%的胆泥最终形成了结石。
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