病毒的传播依赖其外膜蛋白对细胞的附着和侵入，稳定的HBV变异株，经体外转染和猩猩实验感染表明仍能复制;但一般变异毒株的病毒蛋白分泌较少在细胞积聚，故一般变异株传染性较弱。只有少数较稳定的变异株，可在小范围内传播。
母婴传播的病毒同源性调查较能明确阐明期传播关系。母亲感染的毒株群体中只有一小部分传播给新生儿;母亲感染的少数毒株可成为新生儿感染的优势株;新生儿还可出现新的毒株，未必是其感染后新出现的变异株，可能在母亲的病毒群体中所占过少难以检出，而在新宿主内得以扩增。提示变异株的传播按其生物学特性而有所选择。在慢性HBV感染的个体中，常发现有多数异质的毒株;而在急性感染的毒株比较单一。提示病毒在人体内的演变，原型毒株逐渐减少而变异毒株逐渐增多，尚无证据推测不同毒株群体是由重复感染所获得。
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